MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fusobacterium sp. 4_8 plasmid

Total Repeats: 334

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021277	T	7	7	132	138	0 %	100 %	0 %	0 %	507382353
2	NC_021277	CAA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382353
3	NC_021277	TCA	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382353
4	NC_021277	TCA	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	507382353
5	NC_021277	ATTT	2	8	246	253	25 %	75 %	0 %	0 %	507382353
6	NC_021277	TAA	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382354
7	NC_021277	GAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382354
8	NC_021277	A	6	6	754	759	100 %	0 %	0 %	0 %	507382354
9	NC_021277	TTA	3	9	764	772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382354
10	NC_021277	AT	3	6	789	794	50 %	50 %	0 %	0 %	507382354
11	NC_021277	GAT	2	6	827	832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
12	NC_021277	A	6	6	834	839	100 %	0 %	0 %	0 %	507382354
13	NC_021277	ATA	2	6	857	862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382354
14	NC_021277	AG	3	6	881	886	50 %	0 %	50 %	0 %	507382354
15	NC_021277	TA	3	6	905	910	50 %	50 %	0 %	0 %	507382354
16	NC_021277	AAAG	2	8	934	941	75 %	0 %	25 %	0 %	507382354
17	NC_021277	CAAATG	2	12	948	959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	507382354
18	NC_021277	TGA	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
19	NC_021277	TAG	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382354
20	NC_021277	ATT	2	6	1091	1096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
21	NC_021277	TA	3	6	1101	1106	50 %	50 %	0 %	0 %	507382355
22	NC_021277	AT	3	6	1122	1127	50 %	50 %	0 %	0 %	507382355
23	NC_021277	GAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382355
24	NC_021277	TAAA	2	8	1186	1193	75 %	25 %	0 %	0 %	507382355
25	NC_021277	A	6	6	1191	1196	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
26	NC_021277	ATA	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
27	NC_021277	AGAT	2	8	1223	1230	50 %	25 %	25 %	0 %	507382355
28	NC_021277	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
29	NC_021277	A	6	6	1320	1325	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
30	NC_021277	AC	3	6	1374	1379	50 %	0 %	0 %	50 %	507382355
31	NC_021277	ATA	2	6	1390	1395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
32	NC_021277	AG	3	6	1461	1466	50 %	0 %	50 %	0 %	507382355
33	NC_021277	AAG	3	9	1471	1479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
34	NC_021277	ATTT	2	8	1504	1511	25 %	75 %	0 %	0 %	507382355
35	NC_021277	GAA	2	6	1512	1517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
36	NC_021277	GAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
37	NC_021277	AGA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
38	NC_021277	AGATAT	2	12	1557	1568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	507382355
39	NC_021277	GAA	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
40	NC_021277	CTAA	2	8	1608	1615	50 %	25 %	0 %	25 %	507382355
41	NC_021277	GAAT	2	8	1616	1623	50 %	25 %	25 %	0 %	507382355
42	NC_021277	A	6	6	1664	1669	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
43	NC_021277	AGA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
44	NC_021277	GAA	2	6	1707	1712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
45	NC_021277	ATA	2	6	1759	1764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
46	NC_021277	ATT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
47	NC_021277	GA	3	6	1807	1812	50 %	0 %	50 %	0 %	507382355
48	NC_021277	AAG	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
49	NC_021277	AAATT	2	10	1828	1837	60 %	40 %	0 %	0 %	507382355
50	NC_021277	TA	4	8	1895	1902	50 %	50 %	0 %	0 %	507382355
51	NC_021277	T	6	6	1907	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	507382355
52	NC_021277	AGAT	2	8	1916	1923	50 %	25 %	25 %	0 %	507382355
53	NC_021277	GAAA	2	8	1931	1938	75 %	0 %	25 %	0 %	507382355
54	NC_021277	GAA	2	6	1953	1958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
55	NC_021277	TTA	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
56	NC_021277	GAA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
57	NC_021277	AAAGA	2	10	2019	2028	80 %	0 %	20 %	0 %	507382355
58	NC_021277	AAG	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
59	NC_021277	TAA	2	6	2053	2058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
60	NC_021277	AAAAGA	2	12	2063	2074	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	507382355
61	NC_021277	GAAAGA	2	12	2091	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
62	NC_021277	CAAG	2	8	2141	2148	50 %	0 %	25 %	25 %	507382355
63	NC_021277	TAA	2	6	2153	2158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
64	NC_021277	TAAAGA	2	12	2183	2194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	507382355
65	NC_021277	ATA	2	6	2233	2238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
66	NC_021277	AAAT	2	8	2240	2247	75 %	25 %	0 %	0 %	507382355
67	NC_021277	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
68	NC_021277	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
69	NC_021277	GA	3	6	2331	2336	50 %	0 %	50 %	0 %	507382355
70	NC_021277	ACAAGC	2	12	2354	2365	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	507382355
71	NC_021277	ATAGA	2	10	2428	2437	60 %	20 %	20 %	0 %	507382355
72	NC_021277	TAATT	2	10	2447	2456	40 %	60 %	0 %	0 %	507382355
73	NC_021277	GAAAA	2	10	2466	2475	80 %	0 %	20 %	0 %	507382355
74	NC_021277	ATA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
75	NC_021277	GAA	2	6	2520	2525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
76	NC_021277	AGA	2	6	2540	2545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
77	NC_021277	TAA	2	6	2594	2599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
78	NC_021277	A	6	6	2650	2655	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
79	NC_021277	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
80	NC_021277	ATTT	2	8	2683	2690	25 %	75 %	0 %	0 %	507382355
81	NC_021277	AAC	2	6	2713	2718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	507382355
82	NC_021277	CAAG	2	8	2720	2727	50 %	0 %	25 %	25 %	507382355
83	NC_021277	AGAT	2	8	2735	2742	50 %	25 %	25 %	0 %	507382355
84	NC_021277	GAA	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
85	NC_021277	AAT	2	6	2769	2774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382355
86	NC_021277	ATAAA	2	10	2800	2809	80 %	20 %	0 %	0 %	507382355
87	NC_021277	AG	3	6	2829	2834	50 %	0 %	50 %	0 %	507382355
88	NC_021277	AG	3	6	2850	2855	50 %	0 %	50 %	0 %	507382355
89	NC_021277	A	6	6	2874	2879	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
90	NC_021277	AGA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
91	NC_021277	GAAA	2	8	2913	2920	75 %	0 %	25 %	0 %	507382355
92	NC_021277	AGA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
93	NC_021277	AGA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
94	NC_021277	TTA	2	6	3159	3164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382355
95	NC_021277	AT	3	6	3179	3184	50 %	50 %	0 %	0 %	507382355
96	NC_021277	GAA	3	9	3201	3209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
97	NC_021277	A	6	6	3229	3234	100 %	0 %	0 %	0 %	507382355
98	NC_021277	AAAT	2	8	3239	3246	75 %	25 %	0 %	0 %	507382355
99	NC_021277	GAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
100	NC_021277	AGA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382355
101	NC_021277	ATG	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382356
102	NC_021277	T	6	6	3388	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	507382356
103	NC_021277	GAAA	2	8	3429	3436	75 %	0 %	25 %	0 %	507382356
104	NC_021277	AT	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	507382356
105	NC_021277	AGA	2	6	3510	3515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
106	NC_021277	AGA	2	6	3600	3605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
107	NC_021277	GAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
108	NC_021277	AG	3	6	3675	3680	50 %	0 %	50 %	0 %	507382356
109	NC_021277	TAA	2	6	3765	3770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
110	NC_021277	AGA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
111	NC_021277	A	6	6	3807	3812	100 %	0 %	0 %	0 %	507382356
112	NC_021277	AGA	2	6	3819	3824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
113	NC_021277	A	7	7	3852	3858	100 %	0 %	0 %	0 %	507382356
114	NC_021277	AAG	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
115	NC_021277	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	507382356
116	NC_021277	A	7	7	3948	3954	100 %	0 %	0 %	0 %	507382356
117	NC_021277	ATA	2	6	3962	3967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
118	NC_021277	TGA	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382356
119	NC_021277	AAT	2	6	4015	4020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
120	NC_021277	TAA	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
121	NC_021277	TAA	2	6	4074	4079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
122	NC_021277	TTTTA	2	10	4083	4092	20 %	80 %	0 %	0 %	507382356
123	NC_021277	AT	4	8	4099	4106	50 %	50 %	0 %	0 %	507382356
124	NC_021277	T	7	7	4106	4112	0 %	100 %	0 %	0 %	507382356
125	NC_021277	AAT	3	9	4146	4154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382356
126	NC_021277	AATT	2	8	4170	4177	50 %	50 %	0 %	0 %	507382356
127	NC_021277	ATTA	2	8	4224	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	507382356
128	NC_021277	ATT	2	6	4239	4244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382356
129	NC_021277	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	507382356
130	NC_021277	T	7	7	4272	4278	0 %	100 %	0 %	0 %	507382356
131	NC_021277	GAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382356
132	NC_021277	AGA	2	6	5121	5126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	507382357
133	NC_021277	AAT	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382357
134	NC_021277	A	6	6	5230	5235	100 %	0 %	0 %	0 %	507382357
135	NC_021277	TAA	2	6	5236	5241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	507382357
136	NC_021277	ATT	2	6	5331	5336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
137	NC_021277	ATG	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	507382358
138	NC_021277	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	507382358
139	NC_021277	TA	3	6	5459	5464	50 %	50 %	0 %	0 %	507382358
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.